wordpressの中身とかみてると結構大変なのかなと思っていたのですが
SSI(Server Side Includes)が使えれば非常に簡単に実現できます。
.htaccessに以下を追加します。
<Files "xxx.html">
AddOutputFilter INCLUDES .html .htm
</Files>
index.htmlにて呼び出します。
<!--#include FILE="header.html" -->
<!--#include FILE="body.html" -->
たったこれだけ。
なんて簡単なんでしょう、、、